Amennyiben a telepített programra nincs többé szükség, a számítógépről érdemes eltávolítani, hogy az általa lefoglalt erőforrások felszabaduljanak. Windows rendszereken jellemzően egy Uninstall.exe (vagy Eltávolít.exe) program áll rendelkezésre. DOS rendszereken általában egyszerűen törölni kell azt a könyvtárat, amelybe a program feltelepítette magát, illetve esetlegesen az AUTOEXEC.BAT és a CONFIG.SYS fájlokból kell bizonyos bejegyzéseket törölni. (Némely DOS-os program elmenti az eredeti AUTOEXEC.BAT és CONFIG.SYS fájlokat, hogy később visszaállítható legyen az eredeti állapot.) Linuxon az rpm -e csomagnév.rpm parancssorral, illetve (.tgz-telepítés esetén) a make uninstall-lal és (.deb-telepítésnél) a dselect programmal lehet az eltávolítást kezdeményezni.