Elsősorban Windows és DOS operációs rendszereken áll fenn annak az esélye, hogy a telepítő .exe fájl vírusfertőzött. (Linux rendszereken is lehet ilyen jellegű probléma, de amennyiben a forráskódot mellékelik, ennek a valószínűsége nagyon kicsi.) Minden telepítés előtt javasolt a telepítendő programot friss verziójú víruskereső programmal ellenőrizni, s csak azután telepíteni.