SZTE Bolyai Intézet Koronavírus Team

Matematikai modellezés

Járványmatematika projekt



  • A járványmatematika projekt 2020 márciusában indult Röst Gergely vezetésével, célja a COVID-19 járvány magyarországi terjedésének matematikai modellezése és epidemiológiai elemzése. A munkacsoport munkájáról itt lehet bővebben olvasni:

  • Oroszi, Beatrix, J. Krisztina Horváth, Gergő Túri, Katalin Krisztalovics, and Gergely Röst.
  • Az epidemiológiai surveillance és járványmatematikai előrejelzések szerepe a pandémiás hullámok megelőzésében, mérséklésében - hol tartunk most, és hová kellene eljutni.
  • Scientia et Securitas 2, no. 1 (2021): 38-53 https://akjournals.com/view/journals/112/2/1/article-p38.xml


Modellezés


A járványok matematikája hosszú múltra tekint vissza. Az elmúlt évtizedekben a modern laboratóriumi technológiáknak köszönhetően az orvosi, biológiai ismereteink a patogénekről és az immunrendszerről sokkal kiterjedtebbek lettek.  Az epidemiológiai adatok is sokkal nagyobb mennyiségben és részletességben állnak rendelkezésre, mint korábban. A számítógépek új szimulációs és vizualizációs eszközöket, numerikus eljárásokat biztosítanak. Mindez lehetővé teszi, hogy egyre komplexebb és realisztikusabb matematikai modellekkel elemezzük a járványokat.


Több mint tíz éve működik a járványmodellező csoportunk a Szegedi Tudományegyetem, Bolyai Intézet, Alkalmazott és Numerikus Matematika Tanszékén. Az elmúlt években számos fertőző betegséggel foglalkoztunk, például influenza, malária, Zika, Ebola, bárányhimlő, kéknyelv-betegség, kanyaró, polio, kullancs-encephalitis, HiB, diftéria, szamárköhögés terjedésével. A Nemlineáris Dinamika a Biológiában kutatócsoport honlapja itt található.


Az új koronavírussal kapcsolatban a WHO  (Egészségügyi Világszervezet) rendszeresen ad ki helyzetjelentéseket. A február 19-i Situation Report központi témája a matematikai modellezés. Ebben hangsúlyozzák, hogy az elérhető epidemiológiai és klinikai adatok leíró statisztikai elemzése mellett nagyon fontosak a korszerű matematikai modellek, hiszen ezek segítségével lehet pontosabb becsléseket adni a COVID-19 járvány fő paramétereire, előrejelzéseket tenni a jövőbeli terjedésre, kiértékelni az eddigi intézkedések hatását, esetleg új intézkedéseket javasolni. A WHO szorosan együttműködik a matematikai modellezők nemzetközi közösségével.

Tudományos publikációink




Oroszi B., Juhász A., Nagy Cs., Horváth J.K., McKee M., Róza Ádány R. 

The unequal burden of COVID-19 in Hungary: a geographical and socioeconomic analysis of the second wave of the pandemic. BMJ GLOBAL HEALTH, 2021;6:e006427. https://gh.bmj.com/content/6/9/e006427 


David W Dick, Lauren M Childs, Zhilan Feng, Jing Li, Gergely Röst, David Buckeridge, Nick Ogden, Jane M Heffernan

Fall 2021 Resurgence and COVID-19 Seroprevalence in Canada: Modelling waning and boosting COVID-19 immunity in Canada, A Canadian Immunization Research Network Study

medRxiv 2021.08.17.21262188; doi: https://doi.org/10.1101/2021.08.17.21262188  


Childs L, Dick DW, Feng Zh, Heffernan JM, Li J, Röst G 

Modeling waning and boosting of COVID-19 in Canada with vaccination, 

medRxiv, doi: 10.1101/2021.05.18.21257426v1 

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.05.18.21257426v1.full.pdf 


Reguly I, Csercsik D, Juhász J, Tornai K, Bujtár Zs, Horváth G, Keömley-Horváth B, Kós T, Cserey Gy, Iván K,  Pongor S, Szederkényi G, Röst G, Csikász-Nagy A 

Microsimulation based evaluation of COVID-19 management strategies, 

medRxiv, doi: 10.1101/2021.06.20.21259214, in revision, PLOS COMPUTATIONAL BIOLOGY

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2021.06.20.21259214v1.full.pdf 


Marzban S, Han R, Juhász N, Röst G 

A hybrid PDE-ABM model for viral dynamics with application to SARS-CoV-2 and influenza,

bioRxiv, doi: 10.1101/2021.05.07.443053, to appear in ROYAL SOCIETY OPEN SCIENCE

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.05.07.443053v1 


Koltai J, Vásárhelyi O, Röst G, Karsai M 

Monitoring behavioural responses during pandemic via reconstructed contact matrices from online and representative surveys, 

arXiv:2102.09021 https://arxiv.org/pdf/2102.09021.pdf 


Oroszi B, Horváth JK, Túri G, Krisztalovics K, Röst G 

The role of epidemiological surveillance and mathematical forecasting in preventing and mitigating pandemic waves – what has been accomplished and what should be achieved [in Hungarian],

SCIENTIA ET SECURITAS 2, 1 (2021) 38–53, doi: 10.1556/112.2021.00007

https://akjournals.com/view/journals/112/2/1/article-p38.xml 


Barbarossa MV, Bogya N, Dénes A, Röst G, Varma HV, Vizi Zs 

Fleeing lockdown and its impact on the size of epidemic outbreaks in the source and target regions - a COVID-19 lesson,

SCIENTIFIC REPORTS, 11, Article number: 9233 (2021), doi: 10.1038/s41598-021-88204-9

https://www.nature.com/articles/s41598-021-88204-9 


Karsai M, Koltai J, Vásárhelyi O, Röst G

Hungary in mask/MASZK in Hungary,

CORVINUS JOURNAL OF SOCIOLOGY AND SOCIAL POLICY, VOL. 11 (2021)2, 139–146.

doi: 10.14267/CJSSP.2020.2.9

http://cjssp.uni-corvinus.hu/index.php/cjssp/article/download/531/pdf_1 


Bartha F, Karsai J, Tekeli T, Röst G 

Symptom-based testing in a compartmental model of COVID-19

in: Analysis of Infectious Disease Problems (Covid-19) and Their Global Impact (eds. P Agarwal, JJ Nieto, M Ruzhansky, DFM Torres), Springer, 2021, in press

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.10.11.20211037v1.full.pdf 


Péni T, Csutak B, Szederkényi G, Röst G 

Nonlinear model predictive control with logic constraints for COVID-19 management

NONLINEAR DYNAMICS, 102, pp 1965–1986 (2020)

https://link.springer.com/content/pdf/10.1007/s11071-020-05980-1.pdf 


Röst G, Bartha F, Bogya N, Boldog P, Dénes A, Ferenci T, Horváth JK, Juhász A, Nagy Cs, Tekeli T, Vizi Zs, Oroszi B

Early phase of the COVID-19 outbreak in Hungary and post-lockdown scenarios

VIRUSES 12, 708 (2020)

https://www.mdpi.com/1999-4915/12/7/708/pdf 


Bognár B et al., Oroszi B, Röst G Corporate White Book - Practical guide for the preparation and implementation of the corporate COVID-19 pandemic plan

State Secretariat for Economic Strategy and Regulation, Budapest, pp 1–39, ISBN 978-615-81667-0-6

https://vali.ifka.hu/medias/85/corporate_white_book.pdf 


Boldog P, Tekeli T, Vizi Zs, Dénes A, Bartha F, Röst G 

Risk assessment of novel coronavirus COVID-19 outbreaks outside China

JOURNAL OF CLINICAL MEDICINE, 9(2), 571 (2020)

https://www.mdpi.com/2077-0383/9/2/571/pdf 


Szócska, M., Pollner, P., Schiszler, I. et al. Countrywide population movement monitoring using mobile devices generated (big) data during the COVID-19 crisis.

SCIENTIFIC REPORTS 11, 5943 (2021). https://doi.org/10.1038/s41598-021-81873-6

https://www.nature.com/articles/s41598-021-81873-6 


Ferenci, T. 

Different approaches to quantify years of life lost from COVID-19. 

EUR J EPIDEMIOL 36, 589–597 (2021). https://doi.org/10.1007/s10654-021-00774-0




Média válogatás


Február 24-én Röst Gergely beszélt a New Scientist magazinnak az aktuális iráni helyzetről az onnan exportált esetek fényében.


Figyelmeztet a járványügyi matematikus: komoly probléma a brit vírusmutáció hazai megjelenése


Röst Gergely: Itthon is kell állandó járványügyi megfigyelőrendszer


Röst Gergely: Szegedinek érzem magam


Magyar kutatók megírták, hogyan lehet megelőzni egy súlyos járványt és az országos lezárásokat


Olyan gyorsan változik a járvány, hogy alig marad idő gondolkodni


Az egyéni fegyelem a legnagyobb fegyverünk


Covid-19: Online tudományos konferenciát rendeztek


Röst Gergely: A nyitás járványmatematikája - Megéri még egy kicsit türelmesnek lenni


SZTE Szabadegyetem - XXVI. szemeszter: Dr. Röst Gergely - Az új koronavírus matematikája


MASZK


A MASZK a magyarországi szociális kontaktusok mintázatát és a társadalmi attitűdöket monitorozó különleges kutatás. Eddig több mint negyedmillió honfitársunk vett részt benne, segítsen Ön is az alábbi oldalakon: